|
|
Computational modelling of mechanical tests of animal cell
Orlová, Lucie ; Fuis, Vladimír (referee) ; Burša, Jiří (advisor)
Předkládaná diplomová práce se zabývá stavbou živých živočišných buněk a jejich odezvou na mechanické zatěžování. Zobecněným zaměřením práce je popis mechanického chování buňky nejenom ve fyziologickém, ale i v patologickém stavu. Výchozím předpokladem pro úspěšné řešení zadané úlohy je vysoce interdisciplinární přístup kombinující výpočtové přístupy mechaniky těles (v~tomto případě metodu konečných prvků) s lékařským výzkumem. Nejdůležitějším bodem při tvorbě výpočtového modelu, pomocí něhož je možné aproximovat chování živé buňky při zatížení, je zejména identifikace mechanicky významných komponent a~jejich materiálových parametrů. V tomto případě jsou jako mechanicky význačné identifikovány spojité součásti jádro, membrána a cytoplazma, které jsou nově propojeny s prvky diskrétními (mitochondriální sítí) v hybridním modelu, jehož platnost je ověřena pomocí experimentálních dat. Tento model slouží jako podklad k vyhodnocení míry vlivu mitochondrií na celkovou tuhost buňky.
|
|
|
Study of the effect of migrastatics on the dynamics of tumour cell migration using a coherence-controlled holographic microscope
Muchová, Nikola ; Netíková,, Irena Štenglová (referee) ; Veselý, Pavel (advisor)
The thesis is focused on the exploitation of the coherence controlled holographic microscopy for the investigation of the influence of the supposed migrastatic drugs on the dynamics of cancer cell migration. The theoretical part briefly describes the history of holographic microscopy and the development of the holographic microscope at the Brno University of Technology in collaboration with Telight, Brno, including an insight into the design and principle of operation of the coherence-controlled holographic microscope. Next a brief description of current cancer treatments introduces new class of anti-cancer drug candidates designated migrastatics that should impair cancer cell migration and thus prevent late metastases formation. The main part of the thesis deals with the design of the experimental observation procedure and data processing using the holographic incoherent Quantitative Phase Imaging technique. The last part of the thesis is the subsequent analysis of the migrastatic effect of the selected drugs on cancer cells in vitro and the comparison of the obtained results with existing studies. Finally, the objectives with magnification 4x and 10x were evaluated and compared for starting “the Rapid Assessment of Cell Growth and Migration”.
|
|
|
Study of the effect of migrastatics on the dynamics of tumour cell migration using a coherence-controlled holographic microscope
Muchová, Nikola ; Netíková,, Irena Štenglová (referee) ; Veselý, Pavel (advisor)
The thesis is focused on the exploitation of the coherence controlled holographic microscopy for the investigation of the influence of the supposed migrastatic drugs on the dynamics of cancer cell migration. The theoretical part briefly describes the history of holographic microscopy and the development of the holographic microscope at the Brno University of Technology in collaboration with Telight, Brno, including an insight into the design and principle of operation of the coherence-controlled holographic microscope. Next a brief description of current cancer treatments introduces new class of anti-cancer drug candidates designated migrastatics that should impair cancer cell migration and thus prevent late metastases formation. The main part of the thesis deals with the design of the experimental observation procedure and data processing using the holographic incoherent Quantitative Phase Imaging technique. The last part of the thesis is the subsequent analysis of the migrastatic effect of the selected drugs on cancer cells in vitro and the comparison of the obtained results with existing studies. Finally, the objectives with magnification 4x and 10x were evaluated and compared for starting “the Rapid Assessment of Cell Growth and Migration”.
|
|
|
The role of caspase 2 in apoptosis induction in tumor cells.
Schmiedlová, Martina ; Kovář, Jan (advisor) ; Horníková, Lenka (referee)
Within the cell, caspase-2 probably fulfills several functions. Caspase-2 can be involved in apoptosis induction, DNA repair as well as cell cycle regulation. Caspase-2 has the character of initiator and also executioner caspase. A stimulus for caspase 2 activation can be oxidative stress or DNA damage. Caspase-2 is activated by cleavadge during an interaction with protein complexes. One of protein complexes,i.e. PIDDosome, is made of protein PIDD, RAIDD and pro-caspase-2. Withine the PIDDosome, caspase-2 is activated. Activated caspase-2 occures in a short S form and in long L form. L form of caspase-2 has proapoptotic effects and S form of caspase-2 has antiapoptotic effects. Caspase-2S has been only detected on mRNA level but not on protein level. The main role of caspase-2L is apoptosis induction in normal and tumor cells. Caspase-2 in tumour cells is activated by extrinstic as well as intristic apoptotic pathway. Apoptosis induction by caspase-2 is for example studied in connection with breast cancer treatment with taxanes. Caspase-2 ability of apoptosis induction in cancer cells independently of p53 protein is employed in cancer treatment including overcoming the resistance to apoptosis induction which is based on loosing p53 activity. Caspase-2 is involved in apoptosis induction by different...
|
|
|
Computational modelling of mechanical tests of animal cell
Orlová, Lucie ; Fuis, Vladimír (referee) ; Burša, Jiří (advisor)
Předkládaná diplomová práce se zabývá stavbou živých živočišných buněk a jejich odezvou na mechanické zatěžování. Zobecněným zaměřením práce je popis mechanického chování buňky nejenom ve fyziologickém, ale i v patologickém stavu. Výchozím předpokladem pro úspěšné řešení zadané úlohy je vysoce interdisciplinární přístup kombinující výpočtové přístupy mechaniky těles (v~tomto případě metodu konečných prvků) s lékařským výzkumem. Nejdůležitějším bodem při tvorbě výpočtového modelu, pomocí něhož je možné aproximovat chování živé buňky při zatížení, je zejména identifikace mechanicky významných komponent a~jejich materiálových parametrů. V tomto případě jsou jako mechanicky význačné identifikovány spojité součásti jádro, membrána a cytoplazma, které jsou nově propojeny s prvky diskrétními (mitochondriální sítí) v hybridním modelu, jehož platnost je ověřena pomocí experimentálních dat. Tento model slouží jako podklad k vyhodnocení míry vlivu mitochondrií na celkovou tuhost buňky.
|
|
|
The role of caspase 2 in apoptosis induction in tumor cells.
Schmiedlová, Martina ; Horníková, Lenka (referee) ; Kovář, Jan (advisor)
Within the cell, caspase-2 probably fulfills several functions. Caspase-2 can be involved in apoptosis induction, DNA repair as well as cell cycle regulation. Caspase-2 has the character of initiator and also executioner caspase. A stimulus for caspase 2 activation can be oxidative stress or DNA damage. Caspase-2 is activated by cleavadge during an interaction with protein complexes. One of protein complexes,i.e. PIDDosome, is made of protein PIDD, RAIDD and pro-caspase-2. Withine the PIDDosome, caspase-2 is activated. Activated caspase-2 occures in a short S form and in long L form. L form of caspase-2 has proapoptotic effects and S form of caspase-2 has antiapoptotic effects. Caspase-2S has been only detected on mRNA level but not on protein level. The main role of caspase-2L is apoptosis induction in normal and tumor cells. Caspase-2 in tumour cells is activated by extrinstic as well as intristic apoptotic pathway. Apoptosis induction by caspase-2 is for example studied in connection with breast cancer treatment with taxanes. Caspase-2 ability of apoptosis induction in cancer cells independently of p53 protein is employed in cancer treatment including overcoming the resistance to apoptosis induction which is based on loosing p53 activity. Caspase-2 is involved in apoptosis induction by different...
|
guest ::
